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O Herbário da Universidade Estadual de Feira de Santana (HUEFS) foi fundado em 1980, como parte integrante do Departamento de Ciências Biológicas. Atualmente, o herbário ocupa uma área de 754,28 m2. Os espaços estão organizados em: Sala de Processamento de Dados, Sala de Processamento de Material, Sala de Montagem, Sala de Duplicatas, Sala de Arquivo Sala da Coleção Geral, Sala da Curadoria e Almoxarifado.
Atualmente, o HUEFS possui uma coleção de mais de 175.000 exemplares, cadastrados em banco de dados HERBARIO 2.0 desenvolvido pelo professor Dr. Luciano Paganucci. Com este acervo, o HUEFS possui, hoje, a maior coleção de Angiospermas do Nordeste. O número de tipos nomenclaturais depositados é de aproximadamente 845, sendo a maior parte na forma de cibachromes obtidos através do "Projeto de Repatriamento de Dados para a Flora do Nordeste", desenvolvido junto ao Royal Botanic Gardens de Kew. O HUEFS e o TAXON contam também com importante coleção líquida proveniente do desenvolvimento dos projetos Flora da Chapada Diamantina, Leguminosas da Caatinga, Flora dos Inselbergs da Região de Milagres e Flora de Lagoas.
O HUEFS utiliza o gerenciador de Banco de Dados HERBÁRIO 2.0, um software que armazena dados específicos para cada necessidade do usuário, permitindo reunir e utilizar dados sobre espécimes, confeccionar rótulos, emitir relatórios e realizar consultas, como: checklists de áreas, listagens por famílias, listagens por gêneros ou espécies, listagens por coletor, etc. Além do cadastramento das novas amostras, também é realizada a freqüente atualização dos dados existentes, efetivando uma maior agilidade na troca de informações entre herbários.
    Outra importante atividade aqui desempenhada é o intercâmbio com outros herbários, o que possibilita aumentar o acervo do HUEFS através de permutas e a identificação dos táxons, através das doações e empréstimo dos materiais.
O acervo do HUEFS na ultima década teve um crescimento muito significativo passando de cerca de 50.271 espécimes no ano de 2000 para 175.000 espécimes até agosto de 2011.

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